La gare d'Aigues Mortes est officiellement encore ouverte à la desserte marchandises Fret SNCF sous le N°775858, dépendant de la plateforme d'Avignon.
Depuis longtemps inutilisée, la remise a été démolie. L'abri couvert faisant face au BV, le pont tournant et son passage à niveau gardé sont encore en place. Le bâtiment voyageurs est encore partiellement utilisé par la SNCF tandis que la halle à marchandises, un temps abandonnée, est maintenant transformée en magasin.
Etant à l'origine le terminus de la ligne, la gare d'Aigues Mortes comportait, outre un évitement et des voies de débord, un faisceau permettant le garage de rames vides, une remise pour le garage des locomotives à vapeur et un pont de 17 m pour leur tournage. Ces installations semblent avoir été démantelées très rapidement, du temps même de la Compagnie du PLM : elles sont encore visibles sur des vues aériennes de 1921, mais ont disparu sur celles de 1937.
Lors de la prolongation de la ligne au Grau du Roi, un pont tournant accompagné d'un passage à niveau gardé a été mis en place à une dizaine de mètres au Sud de la sortie de la gare. Actuellement, le dépôt et les voie de débord n'existent plus, mais le faisceau de garage reste présent vu la proximité des Salins du Midi, permettant le garage des rames de sel (ce trafic semble avoir cessé il y a quelques années).
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